DM3 Viewer

DM3 Viewer opent DM3-bestanden voor elektronenmicroscopie en rendert geselecteerde 2D-snedes voor snelle inspectie. Het zet ruwe pixelgegevens om in visueel betekenisvolle beelden, terwijl calibratie en metadata behouden blijven voor nauwkeurige metingen. Onderzoekers in materialenwetenschap, biologie en nanotechnologie profiteren van direct toegang tot acquisieparameters en beeldinhoud zonder instrumentsoftware te gebruiken. De tool legt de nadruk op gegevensintegriteit, reproduceerbaarheid en eenvoudige exportpaden voor rapporten en publicaties.
Onder de motorkap leest de DM3-parser koptekstinformatie, detecteert endianness en stemt pixel-arrays af met calibratie. Rendering past standaard contrastinstellingen toe met optionele normalisatie. Metadata zoals apparaatsmodel, dosis, acquisitiedatum en pixellaar grootte worden samengevat in een gestructureerd object. Gebruikers kunnen enkele of meerdere slices aanvragen en exporteren als beeldbestanden, CSV-metingen of JSON-metadata. Het systeem is ontworpen om grote datasets te verwerken door data te streamen en slices on-demand lazy te laden. Differentiators zijn DM3-specifieke metadata-faithfulness, robuuste foutafhandeling en configureerbare calibratie-workflows. Het probeert geen 3D-reconstructie of instrumentcontrole; de focus ligt op offline viewing, QC en data-preparatie. Doelgroepen zijn microscopisten, materiaalwetenschappers en imaging-core-faciliteiten die reproduceerbare resultaten en efficiënte data-uitwisseling vereisen. Use cases omvatten het vergelijken van slice-intensiteiten tussen monsters, het extraheren van pixeldichtheid en dosis voor publicatiefiguren, en het archiveren van beeldsessies met volledige metadata.