Modelbouwer

Een domein-gerichte modelbouwer voor biologie en AI-workflows. Hiermee kunnen gebruikers soorten, interacties en snelheidswetten definiëren, vervolgens dynamiek simuleren en hypothesen vergelijken. De aanpak legt nadruk op expliciete representatie van eenheden, provenance en parameterbeperkingen zodat resultaten auditabel blijven. Het ondersteunt zowel educatieve demonstraties als onderzoek op schaal door modulaire componenten en herbruikbare sjablonen.
Intern worden modellen opgeslagen met expliciete metadata, eenheden en provenance om reproduceerbaarheid over teams en tijd te waarborgen. Het registratiesysteem zorgt voor consistente naamgeving, versiebeheer en traceerbaarheid van elk component, terwijl de solver onafhankelijk blijft van specifieke pad-details. Het systeem integreert met standaardformaten en kan exporteren naar SBML- of JSON-representaties voor uitwisseling.
De tool ondersteunt meerdere modelleringparadigma’s (kinetische snelheidsvergelijkingen, stoichiometrische netwerken, graf-gebaseerde representaties) en interoperabele exports voor downstream analyses. Het maakt scenarioconcurrenties mogelijk door parallele simulaties, afstemming van tijdassen en diff-outputs om de effecten van parameterwijzigingen te benadrukken. Validatieregels detecteren eenhedenfouten, ontbrekende reacties of niet-physische parametergrenzen.