Taxa Converter

Taxa Converter tilbyr rask, regelbasert konvertering av taxonomiske identifikatorer for forskere, undervisere og biokuratorer som trenger tverr-databaser kompatibilitet.

Sjekk selv

Kall verktøy via API Bygg inn på nettstedet ditt Annonser her

Om dette verktøyet

Taxa Converter tilbyr kryss-databasemapping av taxonomiske identifikatorer, navn og rangeringer på tvers av større databaser. Inndata kan leveres som IDs eller kanoniske navn og gir standardiserte utdata med tillitsmålinger for å veilede etterfølgende analyser. Systemet bygger prinsippelt på kryssreferansitabeller, synonymløsningsregler og rang-normalisering for å produsere konsistente taxonreferanser. Det støtter både enkeltoppslag og batch-behandling, slik at forskere kan integrere taxonomiske data i pipelines med minimal manuell kuratering. Brukere drar nytte av mindre manuell kryssreferering, bedre datakvalitet og raskere publiseringsberedskap. Den unike verdien ligger i kombinasjonen av bidireksjonell kartlegging, eksplisitt tillitsmåling og utbyggbar database-støtte, som sammen gjør en robust takson-avstemning på tvers av kilder mulig. Hovedfunksjoner: (1) kilde-til-mål mapping mellom NCBI Taxonomy, ITIS, GBIF, Catalogue of Life og WoRMS; (2) navn-til-ID og ID-til-navn oppløsning med rangjustering; (3) valgfri fuzzy-match med tillitsmetrikk; (4) batch-behandling via API eller filopplasting; (5) eksportklare utdata i JSON, CSV eller TSV. Bruksområder inkluderer data integrasjon for publisering, metadata-kurering og undervisningsdatasett der taksonomisk konsistens er essensiell. Dette verktøyet er utviklet for bioinformaticians, kuratorer og forskere som krever pålitelige cross-database korsninger og revisjon-vennlige utdata for reproduskibel vitenskap.

Logg inn for å se all din bruk

Hvordan bruke

Angi input: oppgi source_taxon eller source_id og velg kilde-databasen.
Velg mål-databasen eller kartleggingsretning.
Kjør konvertering: enkelt oppslag eller batch-behandling.
Gå gjennom utdata: kontroller target_id, target_name, target_rank og tillit.
Eksporter resultater: lagre som CSV eller JSON for pipelines.

Ofte stilte spørsmål / Ytterligere ressurser

Finn raske svar

Hvilke inputs aksepteres?

Hvilke databaser støttes?

Hvordan måles nøyaktighet?

Er batch-behandling tilgjengelig?

I hvilke formater kan utdata eksporteres?

Brukeranmeldelser

Se hva andre sier