Oligo Thermo Analyzer

L’Oligo Thermo Analyzer fornisce stime termodinamiche per oligonucleotidi singoli o duplex per orientare le decisioni di progettazione. Implementa un modello nearest-neighbor per calcolare la temperatura di melting (Tm), il contenuto di GC e ΔG a 37°C, con correzioni di sale opzionali e input di concentrazione per assay contest-specific. Concettualmente le sequenze sono valutate tramite interazioni tra basi e contributi di entalpia ed entropia; gli output riflettono la stabilità dell’interazione nelle condizioni definite dall’utente. Questo strumento è utile a ricercatori che progettano primers, probe o oligos brevi di RNA e necessitano di metriche rapide e ripetibili per confrontare candidati e impostare condizioni sperimentali. Il valore unico risiede nell’integrazione di analisi di oligo singoli e duplex in un unico flusso di lavoro, oltre alla gestione esplicita di forza ionica e concentrazione, migliorando la comparabilità tra esperimenti. Funzioni principali includono validazione degli input, gestione deterministica degli errori per basi non valide o GC estremi, e outputs numerici chiaramente etichettati. Casi d’uso includono ottimizzazione di primers per PCR, progettazione di probes per qPCR e pianificazione di antisense-oligo. I risultati sono adatti per reportistica e pubblicazioni con unità coerenti e formati esportabili.

Questo strumento è rivolto a scienziati di laboratorio e bioinformatici che cercano stime termodinamiche rapide e trasparenti per selezionare sequenze e ottimizzare condizioni.