Analizzatore di tracciamento 15N
Uno strumento mirato per i ricercatori che analizzano dati di tracciamento 15N per quantificare l’arricchimento e i flussi metabolici negli studi metabolici.
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Informazioni su questo strumento
Concettualmente, legge un set di dati tabellare, applica una correzione per l’abbondanza naturale sui segnali 15N, li converte in arricchimento frazionale e aggrega i risultati per metabolita e punto temporale. Se viene fornita o assunta una rete di metaboliti, stima i flussi usando un semplice modello di bilancio di massa e una minimizzazione dei minimi quadrati; l’incertezza può essere approssimata tramite bootstrap.
Le funzioni principali includono ingestione dati; correzione 15N; calcolo di arricchimento frazionale; stima di flussi opzionale; risultati esportabili; supporto per molteplici tempi. Lo strumento utilizza definizioni isotopiche standard e unità SI, agevolando l’uso cross-laboratorio e una documentazione riproducibile.
I casi d’uso includono tracciare l’incorporazione dell’etichetta nel tempo, confrontare condizioni e validare l’attività dei percorsi metabolici. Si distingue offrendo una pipeline integrata di correzione e modellazione minima, adatta a figure pronte per la pubblicazione e analisi riproducibili.
Come usare
- Fornire input: caricare un CSV con le colonne richieste (sample_id, metabolite, time, enrichment_15N) e eventuali fattori di correzione.
- Scegliere il metodo di analisi: isotopomero o bilancio di massa (predefinito).
- Eseguire il calcolo: avviare il flusso di lavoro per produrre arricchimento corretto e stime di flusso.
- Revisionare output: controllare l’arricchimento per metabolita, tendenze nel tempo e statistiche riassuntive.
- Esportare i risultati: scaricare CSV/JSON e, se abilitato, incertezza bootstrap.
Frequently Asked Questions
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Quali input sono richiesti per l’analisi?
Corrige per l’abbondanza naturale?
Quali metodi di stima del flusso sono supportati?
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