Taxa Converter

Taxa Converter offre una conversione rapida basata su regole di identificatori tassonomici per ricercatori, insegnanti e biocuratori che necessitano di compatibilità tra database biologici principali.

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Informazioni su questo strumento

Taxa Converter fornisce mapping cross-database di identificatori, nomi e ranghi tassonomici tra i principali database. Gli input possono essere forniti come ID o nomi canonici e producono output standardizzati con punteggi di affidabilità per guidare le analisi successive. Il sistema si basa concettualmente su tabelle di crosswalk, regole di risoluzione dei sinonimi e normalizzazione dei ranghi per produrre riferimenti tassonomici coerenti. Supporta sia ricerche singole sia elaborazione batch, permettendo agli scienziati di integrare dati tassonomici nelle pipeline con minima curazione manuale. Gli utenti ottengono minori riferimenti incrociati manuali, migliore qualità dei dati e prontezza per la pubblicazione. Il valore unico risiede nella combinazione di mapping bidirezionale, punteggio di fiducia esplicito e supporto estensibile dei database, che insieme consentono un robusto riconciliazione dei taxa tra fonti. Funzionalità chiave: (1) mapping fonte-target tra NCBI Taxonomy, ITIS, GBIF, Catalogue of Life e WoRMS; (2) ricerche Nome-ID e ID-Nome con allineamento dei ranghi; (3) corrispondenza fuzzy opzionale con metriche di fiducia; (4) elaborazione batch via API o caricamento file; (5) output esportabili in JSON, CSV o TSV. Casi d’uso includono integrazione dati per pubblicazioni, curazione metadati e dataset educativi dove la coerenza tassonomica è essenziale. Questo strumento è pensato per bioinformatici, curatori e ricercatori che richiedono corrispondenze affidabili tra database e uscite audit-friendly per scienza riproducibile.

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Come usare

Fornire input: inserire source_taxon o source_id e selezionare il database sorgente.
Scegliere database di destinazione o direzione di mapping.
Eseguire la conversione: singolo lookup o batch.
Revisione output: controllare target_id, target_name, target_rank e confidence.
Esportare i risultati: salvare in CSV o JSON per pipeline.

FAQ/Risorse aggiuntive

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Quali input sono accettati?

Quali database sono supportati?

Come si misura l’accuratezza?

È disponibile l’elaborazione batch?

In quali formati possono essere esportate le uscite?

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