Calcolatore Hardy-Weinberg

Questo strumento calcola le attese di equilibrio Hardy-Weinberg e esegue un test chi-quadro per valutare deviazioni da accoppiamento casuale in popolazioni diploidi. Accetta frequenze di alleli p e q o conteggi di genotipi osservati (AA, Aa, aa) con la dimensione campione totale N. Internamente calcola p e q come p = (2*AA + Aa)/(2N) e q = 1 - p, quindi i conteggi attesi E_AA = p^2 N, E_Aa = 2pqN, E_aa = q^2 N. Una statistica chi-quadro è calcolata come somma di ((O-E)^2/E) tra le classi di genotipo, con df = 1. L'output include i conteggi osservati, p, q, i conteggi attesi, la statistica chi-quadro e la p-valore. L'outil indica anche quando un conteggio atteso è inferiore a 5, rendendo pote facilmente inaffidabile l'approssimazione; suggerisce aggregazioni o test esatti. Gli utenti avanzati possono fornire direttamente le frequenze di alleli per concentrate sulle attese di equilibrio. Risultati utili per documentazione, QC-pipeline e dimostrazioni didattiche.