אופטימיזציית קודונים

הכלי מקבל רצף DNA מקודד ומארח יעד כקלט ומחזיר רצף אופטימלי התואם את שימוש הקודונים של המארח. הוא מספק also יומן substitutions ודירוג מסכם להערכת יכולת הביטוי והסינתזה. הפלט מתאים לזרימת עבודה של קלונינג וסינתזת גנים.
המערכת מקצה לכל מיקום אמינואידי קודון מועדף בהתבסס על טבלת השימוש של המארח, תוך אכיפת מגבלות כגון טווח GC והימנעות ממוטיבים. היא מחושבת דירוג ביטוי ורושמת substitutions, המאפשרים שחזוריות ועקיבות לאורך מחזורי עיצוב.
מדענים המעצבדים construct עבור E. coli, yeast או תאים של יונקים ירו את תוצאת ביטוי מהירה יותר וביטחון גדול יותר. הכלי שוֹנָה ב-something bias-aware scoring, configurable constraints, batch processing, ודוחות שקופים שניתן לייצא לפורמטים סטנדרדיים.
אימות קלט, תמיכת טבלאות codon של המארח, טבלאות מותאמות אופציונאליות, בקרות GC, סינון מוטיבים, מצב batch, מפת CODON לכל codon וייצוא ב-FASTA וב-CSV תומכים בזרימות עבודה טיפוסיות לשיפור הביטוי של גן מקודד במארח שאינו טבעי או להכנת constructים לפייפס סינתזה בהיקף גבוה.