Oligo Analyzer
Analyse les séquences d'oligo pour calculer le contenu GC, la température de fusion et des métriques de qualité pour les chercheurs, les enseignants et les équipes biotech prévoyant des expériences.
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À propos de cet outil
L'outil valide les séquences d'entrée, calcule le contenu GC et estime la température de fusion en utilisant plusieurs modèles thermodynamiques. Il indique la longueur, le GC%, le Tm et les drapeaux de qualité de base. Des métriques avancées optionnelles incluent le risque hairpin, le risque de self-dimer et le potentiel de cross-dimer. Les sorties sont structurées pour les archives de laboratoire et la génération de rapports. Il prend en charge une session sécurisée et les caractères nucléotidiques standard.
L'outil est conçu pour aider à la révision de la conception des amorces et des oligos, les démonstrations pédagogiques des propriétés de séquence et la documentation QA. Il offre des sorties adaptées à l'inclusion dans les notes de laboratoire, les rapports et les plans expérimentaux.
La valeur ajoutée réside dans la combinaison de plusieurs modèles thermo, une reporting clair des métriques et des résultats exportables alignés sur les workflows de laboratoire courants, tout en évitant les instructions de laboratoire humide.
Comment utiliser
- Fournir les entrées: collez ou téléchargez une séquence d'ADN, définissez la concentration saline et le modèle d'analyse.
- Choisir les options d'analyse: contenu GC, modèle Tm, vérifications hairpin et self-dimer.
- Lancer le calcul: l'outil calcule le pourcentage GC, le Tm en °C, la longueur et les scores de risque.
- Examiner les sorties: vérifier les métriques, la température d'appoint recommandée et les options d'exportation.
- Exporter ou copier les résultats: générer CSV ou les copier dans les rapports.
Frequently Asked Questions
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Quelles entrées sont requises et quels formats sont pris en charge ?
Comment la température de fusion est-elle calculée ?
Puis-je entrer de l'ARN ou des oligos modifiés ?
Comment utiliser les résultats dans les rapports ?
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