Constructeur de Modèles

Un constructeur de modèles axé domaine pour la biologie et les flux de travail IA. Il permet aux utilisateurs de définir des espèces, des interactions et des lois de vitesse, puis de simuler les dynamiques et de comparer des hypothèses. L’approche met l’accent sur une représentation explicite des unités, de la provenance et des contraintes de paramètres afin que les résultats restent audités. Il prend en charge à la fois les démonstrations pédagogiques et les projets de recherche à l’échelle en offrant des composants modulaires et des modèles réutilisables.
À l’interne, les modèles sont stockés avec des métadonnées explicites, des unités et la provenance pour assurer la reproductibilité entre les équipes et dans le temps. Le registre garantit une nomenclature cohérente, versioning et traçabilité de chaque composant, tandis que le solveur reste indépendant des détails des parcours. Le système s’intègre aux formats standards et peut exporter vers SBML ou des représentations JSON pour les échanges.
L’outil prend en charge plusieurs paradigmes de modélisation (équations cinétiques, réseaux stœchiométriques, représentations basées sur les graphes) et des exports interopérables pour des analyses en aval. Il permet des comparaisons de scénarios par des simulations parallèles, l’alignement des axes temporels et le diff des sorties pour mettre en évidence les effets des changements de paramètres. Des règles de validation détectent les incohérences d’unités, les réactions manquantes ou les bornes de paramètres non physiques.