Calculateur Hardy-Weinberg

Calcule les attentes de génotypes Hardy-Weinberg et les tests à partir des fréquences d'allèles ou des génotypes observés, pour les chercheurs, étudiants et analystes en génétique des populations.

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À propos de cet outil

Cet outil calcule les attentes d'équilibre Hardy-Weinberg et réalise un test du chi carré pour évaluer les écarts par rapport à un accouplement aléatoire dans des populations diploïdes. Il accepte soit les fréquences d'allèles p et q, soit les comptes de génotypes observés (AA, Aa, aa) avec la taille d'échantillon totale N. En interne, il calcule p et q comme p = (2*AA + Aa)/(2N) et q = 1 - p, puis les comptes attendus E_AA = p^2 N, E_Aa = 2pqN, E_aa = q^2 N. Une statistique chi carré est calculée comme la somme ((O-E)^2/E) sur les classes de génotypes, avec df = 1. Les sorties incluent les comptes observés, p, q, les comptes attendus, la statistique du chi carré et la valeur-p. Le outil signale également lorsque des comptes attendus sont inférieurs à 5, ce qui peut rendre l'approximation du chi carré peu fiable, et suggère des regroupements de classes ou des tests exacts selon le contexte. Les utilisateurs avancés peuvent fournir directement les fréquences d'allèles pour se concentrer sur les attentes d'équilibre sans passer par les comptes observés. Les résultats conviennent pour la documentation, les pipelines QC et les démonstrations pédagogiques.

Comment utiliser

  1. Choisissez le mode d'entrée: saisie des comptes de génotypes observés (AA, Aa, aa) et N, ou fréquence p (q = 1-p).
  2. Le outil calcule p, q et les comptes génotypiques attendus sous HWE.
  3. Puis il effectue le test du chi carré et rapporte la statistique et la valeur-p.
  4. Interprétez les résultats dans le contexte de la taille de l'échantillon et de la fiabilité des comptes.
  5. Exportez ou enregistrez les résultats numériques pour une analyse ultérieure.
How to use hwe online calculator

Frequently Asked Questions

Trouvez des réponses rapides

Qu'est-ce que l'équilibre Hardy-Weinberg ?
L'équilibre Hardy-Weinberg décrit les fréquences génotypiques attendues en cas de reproduction aléatoire sans forces évolutives. Pour deux allèles, p et q sont les fréquences d'allèles, et les fréquences génotypiques attendues sont p^2 (AA), 2pq (Aa) et q^2 (aa).
Comment calculer p et q à partir des comptes de génotypes ?
À partir des comptes AA, Aa, aa et de N: p = (2*AA + Aa) / (2N) et q = 1 - p. Ces valeurs servent à calculer les comptes attendus sous HWE et à effectuer le test du chi carré.
Que faire si certains comptes attendus sont petits ?
Si un ou plusieurs comptes attendus sont inférieurs à 5, l'approximation du chi carré peut être peu fiable. Envisagez de regrouper des classes de génotypes ou d'utiliser un test exact ou une approche par permutation.
Puis-je entrer directement les fréquences d'allèles ?
Oui. Vous pouvez saisir p (et q = 1-p) directement pour calculer les fréquences et comptes génotypiques attendus sans données de génotypes observés. Le outil rapporte ensuite p, q et les valeurs de p^2, 2pq, q^2.

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