Outil de conception siRNA

L’outil permet la conception informatique de séquences siRNA pour le knockdown des gènes. Les utilisateurs indiquent un transcript cible ou un identifiant de gène, l’espèce et la longueur souhaitée (19–21 nt). Le système parcourt la séquence cible et génère des séquences candidates tout en appliquant des contraintes pour assurer la fabricabilité et la faisabilité expérimentale. Il met l’accent sur la transparence du scoring et permet d’examiner plusieurs cycles de candidatures, de sélectionner les meilleures options et d’exporter les résultats pour la planification de la synthèse. Le flux est conçu pour les chercheurs en biologie moléculaire et biotechnologie.
La logique centrale combine des estimations d’efficacité sur la cible avec des vérifications de sécurité. Pour chaque candidat, l’outil calcule le contenu GC, évite les motifs problématiques, évalue la complémentarité de la région seed et estime les propriétés thermodynamiques. Le risque hors-cible est évalué en alignant le candidat sur des transcriptomes de référence pour identifier les hits proches dans les régions codantes et régulatrices, puis une note composite est produite. Les sorties incluent la séquence siRNA, la position dans le transcript, le GC, ΔG prédit et un score hors-cible; des annotations optionnelles signalent SNPs, isoformes ou régions conservées. Public visé: laboratoires académiques, CRO et startups biotech recherchant des cycles de conception rapides et reproductibles, supportant des cibles humaines et modèles; exportation disponible pour validation et sans dépendance au delivery en aval. Les différenciateurs incluent une logique de scoring transparente, contraintes configurables et alignement sur des références transcriptomiques standard, favorisant la reproductibilité. Il n’effectue pas de validation wet-lab ni de guidance clinique mais accélère le criblage in silico et la priorisation des candidats.