CZI Viewer

Outil local permettant d’importer et visualiser les images Zeiss CZI de microscopie, avec rendu multi-canaux, accès rapide aux métadonnées et aperçus miniatures.

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À propos de cet outil

Le CZI Viewer permet l’affichage hors ligne des fichiers Zeiss CZI de microscopie. Il décode les données multi-canaux et affiche une image prête à l’inspection rapide. Il prend en charge la sélection de canaux, le tiling pour les gros fichiers et l’accès basique aux métadonnées. L’accent est mis sur la confidentialité des données, les traitements restant locaux et aucun upload n’est effectué sans export explicite. Grâce à un rendu efficace, les chercheurs peuvent évaluer rapidement la qualité des acquisitions et l’alignement des canaux sans quitter l’environnement sécurisé. L’outil permet aussi d’exporter les aperçus rendus et les métadonnées pour les workflows en aval et les rapports QC. Son architecture privilégie la compatibilité avec les pratiques courantes et reste légère et scriptable pour une intégration dans les pipelines de laboratoire. Cette combinaison offre une option différenciée et respectueuse de la vie privée pour les équipes d’imagerie et les gestionnaires de données.

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Comment utiliser

Fournir des entrées : importer un fichier CZI ou pointer vers un chemin local
Configurer les canaux : sélectionner les canaux actifs et les mapping de couleur
Lancer le rendu : générer une sortie raster et des miniatures
Consulter les métadonnées : vérifier les paramètres d’acquisition et les données d’étalonnage
Exporter : enregistrer les vues rendues ou les métadonnées dans des fichiers

Frequently Asked Questions

Trouvez des réponses rapides

Quels types de fichiers sont pris en charge ?

L’outil prend en charge les fichiers Zeiss CZI (.czi) et extrait les métadonnées intégrées. TIFF ou d’autres formats ne s’ouvrent pas nativement sans conversion, et les acquisitions multi-canaux avec contrôles d’intensité par canal sont gérées.

Puis-je extraire des métadonnées ?

Oui. Le viewer affiche la date d’acquisition, l’objectif, le grossissement, les étiquettes de canal et les données de calibration lorsque présentes. Si des métadonnées manquent, les champs disponibles s’affichent et les valeurs manquantes restent vides.

Le traitement est-il local ou cloud ?

Le traitement est local dans le navigateur ou l’environnement client, selon le déploiement. Aucune donnée n’est téléchargée sauf export explicite, garantissant la confidentialité.

Existe-t-il des limites de taille ou de performance ?

La performance dépend du matériel ; les très gros fichiers CZI peuvent nécessiter un tiling et un rendu progressif. L’outil utilise un accès en mémoire efficace et basé sur des tiles et donne des conseils si les ressources atteignent leurs limites.

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