MRC Decoder

Una herramienta para decodificar cabeceras MRC/CCP4 y proporcionar metadatos rápidos para investigadores que trabajan con mapas de densidad electrónica volumétricos.

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Client-Side Privacy
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Worked Example & Common Values

Below is a sample worked calculation demonstrating how MRC Decoder processes input data instantly inside your browser.

Sample Input Minified string: {"id":1,"status":"active","roles":["admin"]}
Computed Result { "id": 1, "status": "active", "roles": [ "admin" ] }
Execution Mode Client-Side In-Browser JS
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Sobre esta herramienta

El MRC Decoder lee cabeceras estándar MRC/CCP4 para revelar metadatos clave necesarios para el procesamiento posterior. Expone dimensiones (NX, NY, NZ), modo (MODE), origen y banderas de mapa, junto con estadísticas simples derivadas del bloque de datos. Esto permite a los investigadores verificar rápidamente la compatibilidad con herramientas de visualización y pipelines de análisis. Conceptualmente, la herramienta trata el mapa como una matriz de vóxeles 3D y valida la cabecera antes de acceder a los valores. Analiza la cabecera, determina el tipo de datos adecuado a partir de MODE y verifica la firma MAP para confirmar endianness e integridad. Si se solicita, calcula min, max y media sobre los vóxeles para controles de QA y documentación de procedencia. Útil antes de segmentación, refinamiento o análisis comparativos donde la coherencia de la cabecera es crítica. Una característica diferenciadora es la validación robusta frente a anomalías comunes de cabecera y la capacidad de procesar en lote varios archivos, exportando un headerJSON estructurado para integraciones en pipelines. Funcionalidades principales: extracción de cabecera, validación de endianness, interpretación de datatype y estadísticas básicas. Casos de uso incluyen QA de rutina, verificación de recuento de vóxeles frente al diseño experimental y exportación de metadatos de cabecera para registros de proyecto.

Cómo usar

  1. Proporcione el archivo MRC/CCP4 como entrada y establezca si se debe ejecutar en modo por lotes.
  2. El decodificador analiza la cabecera para extraer NX, NY, NZ, MODE y banderas MAP, validando la firma MAP.
  3. El tipo de datos se interpreta a partir de MODE y se escanea el bloque de datos para calcular min, max y media.
  4. Revise el resumen de cabecera y las estadísticas; exporte como JSON o CSV para pipelines.
  5. Opcionalmente, ejecute el procesamiento por lotes en varios archivos y agregue los resultados para procedencia.
How to use mrc decoder

Frequently Asked Questions

Encuentre respuestas rápidas

¿Qué formatos se soportan?
La herramienta soporta formatos MRC y CCP4 estándar con cabeceras convenciales. Detecta endianness mediante la bandera MAP e interpreta los datos según los valores MODE.
¿Qué salidas se generan?
Las salidas incluyen un header_summary (dimensiones, mode, origin, map flags) y data_stats (min, max, mean). Existe una exportación JSON opcional para pipelines posteriores.
¿Cómo se maneja el endianness?
La herramienta valida la firma MAP y trata de detectar el orden de bytes. Si es necesario, puede reinterpretar los bloques de datos antes de calcular las estadísticas.
¿Puedo procesar múltiples archivos a la vez?
Sí, en modo batch se procesan varias mapas y se generan resúmenes por archivo junto con un informe agregado para provenance y QA.

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