Convertidor VCF a CSV

El Convertidor VCF-CSV transforma datos de variantes VCF a un formato CSV tabular, adecuado para análisis en hojas de cálculo, bases de datos y herramientas BI. La entrada puede ser mediante carga de archivo VCF o pegado de texto VCF, y el CSV generado incluye campos clave como CHROM, POS, ID, REF, ALT, QUAL, FILTER, INFO y FORMAT, con columnas opcionales por muestra. Para registros multi-alélicos, ALT puede expandirse a filas separadas o mantenerse como un único campo, según la configuración. Los campos INFO pueden expandirse a columnas distintas o mantenerse como una columna codificada. Las opciones avanzadas permiten mapeo de columnas dirigido, orden de columnas CSV, conversión de valores INFO numéricos a tipos numéricos y filtros simples para incluir solo registros que cumplan criterios. El convertidor no realiza anotación de variantes; el objetivo es la conversión de formato y datos listos para la tabla.

Detrás de escena, la herramienta usa un parseador robusto en streaming para manejar archivos VCF grandes de forma eficiente sin cargarlos por completo en memoria. Valida la sintaxis VCF, normaliza valores numéricos y garantiza una quotación CSV correcta. Al expandir INFO, se analizan pares clave=valor y se colocan en columnas dedicadas si se selecciona. Si la expansión de datos de muestra está activada, FORMAT/SAMPLE pueden aparecer como columnas separadas o omitirse para una tabla compacta. El delimitador de salida puede configurarse como coma o tabulación para compatibilidad TSV. El convertidor también conserva las líneas de encabezado del archivo VCF (que comienzan con #) al exportar, preservando contexto para procesos posteriores.