FCS-Dateikonverter

Das Tool liest Flow Cytometry Standard (FCS)-Dateien, analysiert Kopfzeile und Datenblöcke und exportiert die Ereignismatrix in das gewählte Format. Konzeptuell ordnet es jedem Kanal eine Spalte und jedem Ereignis eine Zeile zu und bewahrt wichtige Metadaten wie Kanalnamen und Messparameter, wenn gewünscht. Es unterstützt Standard-FCS-Versionen (2.0/3.0) und kann einzelne Dateien oder mehrere Uploads in einem Batch-Workflow verarbeiten. Die Ausgaben umfassen CSV, JSON oder Excel mit einem konsistenten Schema und vorhersehbaren Datentypen. Der Exporter ist darauf ausgelegt, große Datensätze effizient durch Streaming oder chunked Writes zu verarbeiten, um einen hohen Speicherverbrauch zu vermeiden. Benutzer können optional Metadaten zusammen mit den Primärdaten einbeziehen, um Nachvollziehbarkeit und Reproduzierbarkeit zu unterstützen. Dieses Tool ist wertvoll für Forscher, die Kompatibilität mit Tabellenkalkulationen, Datenbanken oder Skripting-Pipelines benötigen, sowie für Core Facilities, die Ergebnisse mit externen Kollaboratoren teilen. Sein einzigartiger Wert liegt in robuster FCS-Analyse, treuer Metadatenerhaltung und flexiblen Exportformaten, geeignet sowohl für manuelle Überprüfung als auch für automatisierte Verarbeitung.