VCF zu Excel Konverter

Über dieses Tool

Dieses Tool wandelt VCF-Variantendaten in eine strukturierte Tabelle um, die sich für eine Tabellenkalkulationsprüfung und Berichte eignet. Es akzeptiert VCF-Dateien oder eingefügte Snippets und erzeugt eine flache Tabelle mit Spalten wie CHROM, POS, ID, REF, ALT, QUAL, FILTER und abgeflachte INFO-Schlüssel. Die Konvertierung bewahrt numerische Typen, wo möglich, und macht multi-allelische Einträge handhabbar, indem entweder Zeilen erweitert oder ALT-Werte zusammengeführt werden. Konzeptuell führt das Tool drei Schritte aus: Fixed Fields parsen, Metadaten extrahieren und flatten, und in ein tabellarisches Format schreiben. Es unterstützt sowohl plain CSV als auch Excel-kompatible XLSX-Ausgaben für die anschließende Analyse in vertrauten Tools. Es richtet sich an Forscher, Bioinformatiker und Datenanalysten, die eine schnelle Dateninspektion, QA-Checks oder die Integration in Dashboards benötigen. Der einzigartige Wert liegt in deterministischer Feld-Flatting, optionaler INFO-Schlüssel-Auswahl und sinnvolle Handhabung großer Dateien durch Streaming oder chunked processing. Kernfunktionen umfassen Input-Flexibilität (Datei oder Text-Eingabe), Feldzuordnung, INFO/FORMAT-Handhabung, pro-Sample-Verarbeitung, Ausgabeformat-Optionen und grundlegende Validierung. Typische Anwendungsfälle sind QA von Variantenlisten, Erstellung von Tabellenzusammenfassungen für Berichte und Vorbereitung der Daten für Filter- und Visualisierungsworkflows. Das Tool konzentriert sich auf rohe Datenumwandlung ohne externe Annotationen, gewährleist Reproduzierbarkeit und Nachprüfbarkeit der resultierenden Tabelle. Es bietet Hinweise darauf, welche INFO-Schlüssel häufig verwendet werden (DP, AF, HET, AC) und wie man Multi-Allele-Einträge in lesbare Zeilen überführt, um den Abgleich zwischen Varianten-Katalogen und Sample-Metadaten zu ermöglichen.

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